Brain Bee地区赛根据组别，考察的内容不一致，但主要的考试内容还是会围绕：脑基础、脑功能、脑疾病、脑研究、脑科学加强这五个板块展开。
BrainBee junior组（5-8年级学生）
活动分为笔试和科学海报制作两个环节：
笔试环节 - 个人赛，分为填空、选择两种题型，中英文试卷，共40题，每题1分，计40分。
科学海报 - 为团体参加，本环节为40分。
学生可与本校或校外晋级全国活动的学生自行组队，每个队伍4-5人。海报主题在现场指定，在规定的时间内完成海报制作并进行演讲，制作时可参阅资料。
BrainBee 组（9-12年级学生）
活动为个人参加，分为笔试、图片/标本识别、病例诊断三个环节
笔试环节 - 分为填空、选择两种题型，每题1分，共50题，计50分。
图片/标本识别- 辨认出标本或CT、MRI等影像中相关大脑结构名称；每题2分，共13题，计26分。
病例诊断- 根据病例信息，对患者疾病作出分析判断；每大题3分，共8题，计24分。
